Король вновь созвал парламент лишь в 1640 году, который вскоре выступил против монарха. Результатом этого конфликта стали две гражданские войны (1642–1646 и 1648 годов), в которых Оливер Кромвель снискал себе славу полководца и выдающегося политического деятеля.
Итак, непримиримые разногласия между английским парламентом и королем привели к тому, что Карл I Стюарт покинул Лондон и уехал на север страны в город Йорк, где роялисты имели сильные позиции. Там сторонники монарха попытались захватить запасы оружия близ города Гулля, но потерпели неудачу. Тогда Карл I отправился в графство Ноттингем, где начал собирать войско для борьбы с парламентом.
22 августа 1642 года в городе Ноттингеме в торжественной обстановке был поднят королевский штандарт. Это означало объявление войны парламенту под предлогом подавления «мятежа графа Эссекса», командовавшего недавно созданной парламентской армией.
В марте 1642 года парламент издал указ – ордонанс, согласно которому лорды-лейтенанты графств должны были собрать англичан, годных для военной службы. 4 июля был создан Комитет обороны, возглавивший военную деятельность парламента. Оливер Кромвель предложил сформировать армию «для защиты палат, истинной религии, свободы законов и мира».
4 июля парламент принял решение о наборе 10-тысячной армии, назначив ее главнокомандующим графа Эссекса. 42-летний Кромвель в чине капитана возглавил добровольческий кавалерийский отряд в 60 всадников, набранный из крестьян и ремесленников.
Кромвель по-своему воспитывал своих солдат и офицеров. Будучи ярым пуританином, он требовал от всех личной честности и железной дисциплины, запретил грабить местное население и сквернословить. Основой военной философии Оливера Кромвеля стало религиозное пуританское рвение. По его мнению, армия не может состоять «из негодяев, пьяниц и всякого рода общественных подонков».
Он заменил вооружение кавалериста. Все солдаты и офицеры конницы Кромвеля имели кремневый пистолет в кобуре. В начале атаки при сближении с врагом они стреляли из этих пистолетов, а затем обнажали свои обоюдоострые трехфутовые мечи и бросались в рукопашную схватку. Кромвеля и его солдат, одетых в стальные кирасы, прозвали «железнобокими».
Успешные действия его добровольческого кавалерийского отряда получили широкую огласку среди сторонников парламента, и он стал командиром полка в чине полковника. Кавалеристы Кромвеля победили роялистов в жестоких боях при Грантхэме и Бэрли-хаус Гейсборо в 1643 году. Полк, состоявший из 14 эскадронов (11 тысяч человек), был вдвое больше по численности обычного конного полка.
Кромвель стал инициатором реформы вооруженных сил парламентской Англии. 19 декабря 1644 года парламент принял «билль о самоотречении», согласно которому парламентарии не имели права занимать командные должности в армии. В армии устанавливается единоначалие. Новым главнокомандующим стал генерал Томас Ферфакс, а его заместителем – Оливер Кромвель, который одновременно командовал кавалерией парламентских сил.
Согласно «биллю о самоотречении», Кромвель не мог занимать командные должности. Но парламент сделал здесь исключение. По его предложению парламент решил сформировать армию нового образца численностью в 22 тысячи человек, состоявшую из 10 полков кавалерии, одного полка драгун (конных солдат-пехотинцев) и 12 полков пехоты.
Построенная на единоначалии парламентская армия отличалась строгостью дисциплины. Оливер Кромвель говорил: «Когда я приказываю, каждый повинуется или немедленно увольняется. Я не терплю возражений от кого бы то ни было».
В боевом уставе новой армии было записано: «Всякий покинувший свой знамя или бежавший с поля боя наказывается смертной казнью… Если часовой или дозорный будут найдены спящими или пьяными… они будут беспощадно наказаны смертью… Воровство или грабеж караются смертью».
В 1644 году парламентским войскам был дан «Солдатский катехизис», который разъяснял цели войны против короля. Солдатам внушалось, что их профессия благородна и что, поскольку война носит религиозный характер, на нее их благословляет сам Бог. Одним из главных средств воспитания парламентской армии считалось изучение солдатами Священного Писания.
Парламентская армия в ходе 1-й гражданской войны нанесла войскам английского короля несколько сильных поражений. 2 июня 1644 года произошло сражение при Марстон-Муре. Роялисты (18 тысяч человек) во главе с принцем Рупертом сразились с парламентской 27-тысячной армией и ее союзниками-шотландцами под командованием лорда Ферфакса. Сильная атака кавалерии роялистов была успешно отбита «желознобокими» солдатами Оливера Кромвеля, которые и решили исход битвы после того, как противник разгромил правое крыло армии парламента. В итоге роялисты потеряли контроль над Северной Англией.